實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù)是一種在DNA擴(kuò)增反應(yīng)中,以熒光化學(xué)物質(zhì)測每次聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法。通過內(nèi)參或者外參法對(duì)待測樣品中的特定DNA序列進(jìn)行定量分析。實(shí)時(shí)熒光PCR試劑盒作為這一技術(shù)的載體,在醫(yī)學(xué)診斷、基因表達(dá)研究和遺傳疾病篩查等領(lǐng)域發(fā)揮著重要作用。
一、工作原理
實(shí)時(shí)熒光PCR試劑盒的工作原理基于DNA聚合酶在PCR過程中合成新DNA鏈的特性,結(jié)合熒光標(biāo)記的探針或染料,通過實(shí)時(shí)監(jiān)測熒光信號(hào)的增加來測量PCR反應(yīng)的進(jìn)行程度。具體而言,工作過程包括以下幾個(gè)關(guān)鍵步驟:
1、DNA模板的擴(kuò)增:PCR反應(yīng)中的DNA模板在DNA聚合酶的作用下,經(jīng)過一系列的溫度循環(huán)(變性、退火、延伸)進(jìn)行擴(kuò)增。每個(gè)循環(huán)中,DNA雙鏈在高溫下變性成單鏈,然后引物與單鏈DNA結(jié)合,并在DNA聚合酶的作用下合成新的DNA鏈。
2、熒光信號(hào)的實(shí)時(shí)監(jiān)測:在PCR反應(yīng)體系中加入熒光標(biāo)記的探針或染料。這些熒光物質(zhì)在PCR反應(yīng)過程中,隨著DNA拷貝數(shù)的增加,與DNA產(chǎn)物結(jié)合并發(fā)出熒光信號(hào)。實(shí)時(shí)熒光PCR儀器通過檢測這些熒光信號(hào)的變化,實(shí)時(shí)監(jiān)測PCR反應(yīng)的進(jìn)程。
3、熒光信號(hào)的定量分析:通過實(shí)時(shí)熒光PCR儀器收集到的熒光數(shù)據(jù),可以繪制成熒光強(qiáng)度相對(duì)于循環(huán)數(shù)的圖表。在PCR反應(yīng)早期,熒光信號(hào)較弱,隨著反應(yīng)的進(jìn)行,熒光信號(hào)逐漸增強(qiáng),進(jìn)入指數(shù)增長期。當(dāng)反應(yīng)達(dá)到一定的熒光強(qiáng)度閾值時(shí),所需的循環(huán)數(shù)被稱為Ct值(Cyclethreshold)。研究表明,每個(gè)模板的Ct值與該模板的起始拷貝數(shù)的對(duì)數(shù)存在線性關(guān)系,起始拷貝數(shù)越多,Ct值越小。
4、定量計(jì)算:利用已知起始拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)品制作標(biāo)準(zhǔn)曲線,標(biāo)準(zhǔn)曲線的橫坐標(biāo)代表起始拷貝數(shù)的對(duì)數(shù),縱坐標(biāo)代表Ct值。對(duì)于未知樣品,只要獲得其Ct值,即可從標(biāo)準(zhǔn)曲線上計(jì)算出該樣品的起始拷貝數(shù)。
實(shí)時(shí)熒光PCR試劑盒中的熒光物質(zhì)可以分為兩類:熒光探針和熒光染料。熒光探針通常是一段與目標(biāo)DNA序列互補(bǔ)的寡核苷酸,兩端分別標(biāo)記有熒光基團(tuán)和淬滅基團(tuán)。當(dāng)探針與目標(biāo)DNA序列結(jié)合時(shí),熒光基團(tuán)和淬滅基團(tuán)接近,熒光信號(hào)被淬滅。在PCR延伸過程中,DNA聚合酶將探針切割,熒光基團(tuán)和淬滅基團(tuán)分離,熒光信號(hào)增強(qiáng)。熒光染料則是一種能夠非特異性地結(jié)合到DNA雙鏈上的小分子,當(dāng)DNA雙鏈增多時(shí),染料結(jié)合量增加,熒光信號(hào)增強(qiáng)。
二、優(yōu)勢
實(shí)時(shí)熒光PCR試劑盒相比傳統(tǒng)PCR方法具有以下幾個(gè)顯著優(yōu)勢:
1、快速準(zhǔn)確:實(shí)時(shí)熒光PCR能夠在較短時(shí)間內(nèi)完成DNA的檢測和定量,通常只需幾個(gè)小時(shí)。同時(shí),通過實(shí)時(shí)監(jiān)測熒光信號(hào)的變化,能夠提供可靠的擴(kuò)增效率和準(zhǔn)確的定量結(jié)果。
2、高靈敏度:能夠檢測極少量的目標(biāo)DNA序列,甚至達(dá)到單拷貝水平的靈敏度。這使得實(shí)時(shí)熒光PCR成為檢測低濃度DNA樣本的理想選擇。
3、定量檢測:實(shí)時(shí)熒光PCR通過熒光信號(hào)的變化,可以對(duì)DNA產(chǎn)物進(jìn)行實(shí)時(shí)定量檢測,無需后續(xù)分析。這一特性使得實(shí)時(shí)熒光PCR在病毒載量監(jiān)測、基因表達(dá)研究等領(lǐng)域具有廣泛應(yīng)用。
4、多重檢測:通過使用不同的熒光標(biāo)記和探針,可以同時(shí)檢測多個(gè)DNA序列。這一特性大大提高了檢測效率,減少了樣本量和試劑消耗。
5、自動(dòng)化和高通量:實(shí)時(shí)熒光PCR試劑盒可以與實(shí)時(shí)熒光PCR儀器結(jié)合使用,實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化操作和高通量檢測。這使得實(shí)時(shí)熒光PCR成為處理大量樣本的理想選擇,特別適用于大規(guī)模篩查和診斷。
6、廣泛的應(yīng)用領(lǐng)域:實(shí)時(shí)熒光PCR試劑盒在醫(yī)學(xué)診斷、基因表達(dá)研究、遺傳疾病篩查、藥物療效考核、腫瘤基因檢測等領(lǐng)域具有廣泛應(yīng)用。通過實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù),我們能夠更好地了解DNA的特性,推動(dòng)科學(xué)研究和醫(yī)學(xué)診斷的進(jìn)步。
三、應(yīng)用案例
1、醫(yī)學(xué)診斷:實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù)在醫(yī)學(xué)診斷中具有重要作用。例如,在結(jié)核菌基因診斷中,實(shí)時(shí)熒光PCR可以區(qū)分結(jié)核桿菌與其他分枝桿菌,檢測結(jié)核桿菌的耐藥基因,提高結(jié)核病的陽性檢出率。在產(chǎn)前診斷中,實(shí)時(shí)熒光PCR可以從孕婦的外周血中分離胎兒DNA,進(jìn)行無創(chuàng)傷性的性別鑒定和遺傳性疾病篩查。
2、基因表達(dá)研究:實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù)是研究基因表達(dá)的重要手段。通過實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù),可以定量檢測特定基因的表達(dá)水平,研究基因表達(dá)與疾病之間的關(guān)系,為疾病的診斷和治療提供科學(xué)依據(jù)。
3、遺傳疾病篩查:實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù)在遺傳疾病篩查中發(fā)揮著重要作用。通過檢測特定基因的突變或缺失,可以預(yù)測個(gè)體患遺傳疾病的風(fēng)險(xiǎn),為早期干預(yù)和治療提供依據(jù)。
4、藥物療效考核:實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù)在藥物療效考核中具有重要應(yīng)用。例如,在乙型肝炎病毒(HBV)和丙型肝炎病毒(HCV)的定量分析中,實(shí)時(shí)熒光PCR可以檢測病毒載量,評(píng)估藥物的療效和病毒變異情況。
5、腫瘤基因檢測:實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù)在腫瘤基因檢測中具有廣泛應(yīng)用。通過檢測腫瘤相關(guān)基因的突變和表達(dá)水平,可以預(yù)測腫瘤的發(fā)生和發(fā)展,為腫瘤的診斷和治療提供科學(xué)依據(jù)。